StarLighter Probe qPCR Mix (Universal)
產品簡述:
StarLighter Probe qPCR Mix (Universal) 是一款基于探針法對各種來源的DNA樣本進行快速定量、實時分析的通用試劑盒。性能優異的熱啟動基因工程改造Taq DNA polymerase,配合基于探針法qPCR優化的緩沖液,可以有效抑制非特異性擴增,大大增加qPCR擴增效率,適用于進行高靈敏度的qPCR反應。參比染料ROX隨試劑盒提供。
本產品使用前只需要加入引物、模板、探針、ROX(根據使用的機型而定)和水。定量范圍寬,可以對靶基因進行準確的定量、定性和SNP檢測;本產品具有重復性好,可信度高,并兼容各種不同類型的qPCR探針的特點。
產品優勢:
l 擴增特異性強,數據結果可靠;
l 高GC模板擴增能力強;
l 擴增效率高,Ct值提前 ;
l 信噪比高,低copy檢測靈敏度高。
產品應用:
l 基因表達分析;
l SNP和等位基因分型;
l 測序和微陣列結果的驗證。
產品性能比較:
利用ARMS-qPCR技術對ApoE兩個基因亞型ApoE2、ApoE3進行分型:以攜帶ApoE3基因亞型的人類基因組為模板,設計兩對亞型特異性引物(對應亞型可以擴增,非對應亞型不能擴增。與某競品平行測試。
ACTB:內參基因;ApoE: 待測基因(片段長度197bp,GC含量71%)
1、擴增特異性強,數據結果可靠

Fig1:使用StarLighter Probe qPCR Mix(Universal)試劑,利用攜帶ApoE3基因亞型的人類基因組為模板,AopE2沒有擴增,AopE3擴增良好,說明StarLighter Probe qPCR Mix(Universal)目的產物擴增特異性好; 競品未能擴增出高GC片段。
2. 高GC模板擴增能力強
Table1:使用StarLighter Probe qPCR Mix(Universal)試劑,利用攜帶ApoE3基因亞型的人類基因組為模板,和競品ct值比較
模板 5ng | Ct值ApoE2 | Ct值ApoE3 |
StarLighter Probe qPCR Mix(Universal) | >45 | 28.08 |
競品 | >45 | >45 |

Fig2:以人基因組為模板,模板濃度分別為50ng、5ng、0.5ng、0.05ng,擴增ApoE3基因,擴增片段長度197bp,GC含量71%。使用StarLighter Probe qPCR Mix(Universal)試劑可得到有效擴增,而競品沒有擴增出ApoE3(Ct>45)。
3. 普通GC含量模板擴增效率高,梯度稀釋線型范圍好
a、StarLighter Probe qPCR Mix(Universal)與競品擴增內參基因ACTB比較

Fig3:以人基因組為模板,模板濃度分別為50ng、 5ng、0.5ng、0.05ng,擴增內參基因ACTB基因,擴增片段長度179bp,使用StarLighter Probe qPCR Mix(Universal)可有效擴增ACTB基因,擴增效率和R2值均優于競品。CT值比競品提前約1-1.5個cycle。
4、低拷貝模板檢測靈敏度高
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Fig4:以人類基因組為模板,模板起始濃度為100ng,將模板進行5倍梯度稀釋,使用StarLighter Probe qPCR Mix (Universal)試劑。當模板濃度低至0.032ng時,內參基因ACTB和目的基因ApoE3仍能得到有效擴增,且起始模板量的log值和其Ct值線性關系良好。
5、高穩定性

Fig5:不同凍融次數對StarLighter Probe qPCR Mix (Universal)試劑的穩定性影響,加入不同起始量模板情況下,不同凍融次數的擴增曲線重復性良好。

Fig6 : 37℃處理5天對StarLighter Probe qPCR Mix (Universal)試劑的穩定性影響。加入不同起始量模板情況下,37℃儲存5天試劑的擴增曲線與未經37℃處理的試劑的擴增曲線重復性良好。

Fig7 : 室溫處理28天對StarLighter Probe qPCR Mix (Universal)試劑的穩定性影響。加入不同起始量模板情況下,室溫處理28天試劑的擴增曲線與未經室溫處理的試劑的擴增曲線重復性良好。(本實驗在Q6上完成)

Fig8 : 4℃處理43天對StarLighter Probe qPCR Mix (Universal)試劑的穩定性影響。加入不同起始量模板情況下,4℃處理43天試劑的擴增曲線與未經 4℃處理的試劑的擴增曲線重復性良好。(本實驗在Q6上完成)
產品在人類基因分型中的應用實例:
實例一
以已知分型的不同個體人類血液提取的基因組為模板,設計ApoE基因亞型特異性引物,使用StarLighterProbe qPCR Mix(Universal),通過qPCR擴增對不同個體攜帶的ApoE基因進行分型,得到的分型結果與已知分型情況一致。
Table2:不同個體人類基因組ApoE分型
StarLighterProbe qPCR Mix(Universal)分型 | 已知分型 | ||||
樣本編號 | 基因型 | rs429358 | rs7412 | rs429358 | rs7412 |
201907000001 | e3/e3 | TT | CC | TT | CC |
201907000002 | e3/e3 | TT | CC | TT | CC |
201907000003 | e2/e3 | TT | CT | TT | CT |
201907000004 | e2/e3 | TT | CT | TT | CT |
201907000005 | e2/e4 | TC | CT | TC | CT |
201907000006 | e3/e3 | TT | CC | TT | CC |
201907000007 | e3/e3 | TT | CC | TT | CC |
201907000008 | e3/e3 | TT | CC | TT | CC |
201907000009 | e3/e4 | TC | CC | TC | CC |
201907000010 | e3/e3 | TT | CC | TT | CC |
201907000011 | e3/e3 | TT | CC | TT | CC |
201907000012 | e3/e3 | TT | CC | TT | CC |
實例二
G719S(18外顯子)、T790M(外顯子)是位于表皮生長因子受體(EGFR)基因不同外顯子上的突變點,這些突變與肺癌,宮頸癌等癌癥的靶向用藥有關。G719S(18外顯子)、T790M(外顯子)兩個突變的篩查可用于指導不同靶向藥物的使用。
通過將待檢測突變位點設計在探針中間,以人類基因組為模板,通過qPCR基因分型結果可以判斷是否攜帶該突變。
Fig9:使用StarLighter Probe qPCR Mix(Universal)和競品進行基因分型,結果一致
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